Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN1CP49918 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN1CP49918 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN1CP49918 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms