Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN2BP42772 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN2BP42772 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms