Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2E1P29083 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms