Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL2P13500 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL2P13500 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL2P13500 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL2P13500 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL2P13500 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL2P13500 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL2P13500 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL2P13500 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL2P13500 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL2P13500 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL2P13500 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL2P13500 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL2P13500 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL2P13500 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL2P13500 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL2P13500 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL2P13500 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL2P13500 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL2P13500 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCL2P13500 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms