Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RLBP1P12271 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RLBP1P12271 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms