Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6CP09669 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6CP09669 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6CP09669 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6CP09669 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6CP09669 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6CP09669 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6CP09669 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6CP09669 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6CP09669 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6CP09669 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms