Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPN1P04843 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN1P04843 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN1P04843 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN1P04843 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN1P04843 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN1P04843 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN1P04843 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN1P04843 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN1P04843 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN1P04843 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPN1P04843 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPN1P04843 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPN1P04843 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPN1P04843 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPN1P04843 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPN1P04843 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPN1P04843 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPN1P04843 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPN1P04843 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPN1P04843 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPN1P04843 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPN1P04843 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPN1P04843 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPN1P04843 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPN1P04843 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPN1P04843 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms