Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF2P04141 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF2P04141 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF2P04141 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2P04141 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2P04141 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2P04141 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2P04141 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2P04141 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2P04141 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2P04141 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2P04141 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2P04141 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2P04141 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2P04141 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2P04141 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2P04141 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2P04141 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF2P04141 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF2P04141 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms