Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPO95166 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPO95166 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms