Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN7O94888 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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