Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms