Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCP110O43303 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCP110O43303 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCP110O43303 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCP110O43303 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCP110O43303 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCP110O43303 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCP110O43303 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCP110O43303 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCP110O43303 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCP110O43303 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCP110O43303 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCP110O43303 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCP110O43303 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCP110O43303 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCP110O43303 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCP110O43303 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCP110O43303 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCP110O43303 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCP110O43303 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCP110O43303 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCP110O43303 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCP110O43303 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCP110O43303 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCP110O43303 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCP110O43303 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCP110O43303 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCP110O43303 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCP110O43303 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCP110O43303 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCP110O43303 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCP110O43303 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms