Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAD1O00515 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAD1O00515 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAD1O00515 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAD1O00515 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAD1O00515 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAD1O00515 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAD1O00515 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAD1O00515 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAD1O00515 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAD1O00515 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAD1O00515 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAD1O00515 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAD1O00515 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAD1O00515 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAD1O00515 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAD1O00515 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAD1O00515 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms