Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms