Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMG1C9JSJ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMG1C9JSJ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms