Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCDC2BA2VCK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC2BA2VCK2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms