Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TRBV5-3A0A0A0MS03 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV5-3A0A0A0MS03 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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