Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.012e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.022e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-212ENST00000441588 496 ntTSL 48.71□□□□□ -1.022e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.022e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 APOL2-204ENST00000454728 577 ntTSL 48.41□□□□□ -1.062e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-203ENST00000408981 737 ntTSL 58.26□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-211ENST00000438265 668 ntTSL 37.86□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 PRKCA-204ENST00000583361 519 ntTSL 37.39□□□□□ -1.232e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.242e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 AL049875.1-203ENST00000557197 495 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 RPE-215ENST00000453724 546 ntTSL 55.96□□□□□ -1.462e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.562e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 44.64□□□□□ -1.672e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.43□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 44.06□□□□□ -1.762e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 22.85□□□□□ -1.952e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMEM214-213ENST00000495312 804 ntTSL 225.63■■□□□ 1.691e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 SLC4A2-208ENST00000469467 442 ntTSL 29.25□□□□□ -0.931e-7■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 220.63■□□□□ 0.891e-13■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 219.61■□□□□ 0.731e-13■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-13■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.061e-13■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 PYCR1-213ENST00000584848 949 ntTSL 513.97□□□□□ -0.171e-13■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 511.93□□□□□ -0.51e-13■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.31■■□□□ 1.324e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 516.67■□□□□ 0.264e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.174e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 314.88□□□□□ -0.034e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.364e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 311.35□□□□□ -0.594e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMBIM6-222ENST00000550445 761 ntTSL 310.98□□□□□ -0.654e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 ARHGAP17-209ENST00000571843 1292 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.655e-15■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 ARHGAP17-206ENST00000571406 1135 ntTSL 310.19□□□□□ -0.785e-15■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 49.94□□□□□ -0.824e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 48.19□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMBIM6-211ENST00000548201 582 ntTSL 47.65□□□□□ -1.184e-8■□□□□ 8.9
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PCBP2Q15366 TMBIM6-204ENST00000546796 556 ntTSL 57.51□□□□□ -1.214e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMBIM6-226ENST00000552635 574 ntTSL 47.49□□□□□ -1.214e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMBIM6-210ENST00000547832 640 ntTSL 36.45□□□□□ -1.384e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 GPAM-203ENST00000480130 514 ntTSL 26.15□□□□□ -1.424e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 TMBIM6-207ENST00000547013 428 ntTSL 25.3□□□□□ -1.564e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 GPAM-204ENST00000498541 351 ntTSL 34.2□□□□□ -1.744e-8■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 ARHGAP35-205ENST00000599284 931 ntTSL 213.29□□□□□ -0.289e-9■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 LGR5-206ENST00000550851 4095 ntTSL 211.39□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 LGR5-203ENST00000540815 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 314.17□□□□□ -0.141e-25■□□□□ 8.9
PCBP2Q15366 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.444e-8■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.54e-8■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 HNMT-208ENST00000485653 675 ntTSL 54.06□□□□□ -1.764e-8■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-9■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-9■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-9■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-11■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.845e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-207ENST00000432226 1042 ntTSL 515.85■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.085e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.035e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -05e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-212ENST00000477863 716 ntTSL 414.9□□□□□ -0.025e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-210ENST00000477104 806 ntTSL 413.88□□□□□ -0.195e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 GSN-213ENST00000483960 802 ntTSL 310.82□□□□□ -0.685e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ZNF219-204ENST00000553296 560 ntTSL 216.54■□□□□ 0.242e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 MIR647-201ENST00000384823 96 ntBASIC10.77□□□□□ -0.697e-26■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 222.19■■□□□ 1.143e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.013e-11■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-11■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 514.16□□□□□ -0.143e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 412.99□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 512.67□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.893e-11■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.963e-11■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 TSPAN14-201ENST00000265450 2588 ntTSL 216.7■□□□□ 0.267e-15■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 AES-210ENST00000590067 1100 ntTSL 215.48■□□□□ 0.071e-17■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.276e-10■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 SLC22A31-204ENST00000568161 651 ntTSL 314.01□□□□□ -0.176e-10■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 CEACAM1-212ENST00000488639 429 ntTSL 311.28□□□□□ -0.67e-19■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 CEACAM1-204ENST00000358394 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.117e-19■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.347e-19■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.347e-19■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 CEACAM1-209ENST00000465051 321 ntTSL 24.33□□□□□ -1.727e-19■□□□□ 8.8
PCBP2Q15366 JAG1-208ENST00000620743 756 ntTSL 37.84□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 JAG1-209ENST00000622545 507 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.164e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HDLBP-220ENST00000442730 683 ntTSL 220.75■□□□□ 0.919e-7■□□□□ 8.7
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