RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442730.1

HDLBP-220, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-220ENST00000442730 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.57■■■■■ 6.33
HDLBP-220ENST00000442730 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.69■■■■■ 5.39
HDLBP-220ENST00000442730 ABCC9O60706 1549 aa47.94■■■■■ 5.26
HDLBP-220ENST00000442730 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.97■■■■■ 4.95
HDLBP-220ENST00000442730 NACADO15069 1562 aa45.84■■■■■ 4.93
HDLBP-220ENST00000442730 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.58■■■■■ 4.89
HDLBP-220ENST00000442730 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.47■■■■■ 4.87
HDLBP-220ENST00000442730 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
HDLBP-220ENST00000442730 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.16■■■■■ 4.82
HDLBP-220ENST00000442730 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.93■■■■■ 4.78
HDLBP-220ENST00000442730 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.69■■■■■ 4.749e-8■□□□□ 9.8
HDLBP-220ENST00000442730 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.64■■■■■ 4.74
HDLBP-220ENST00000442730 SCRIBQ14160 1630 aa44.4■■■■■ 4.7
HDLBP-220ENST00000442730 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.29■■■■■ 4.68
HDLBP-220ENST00000442730 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.15■■■■■ 4.66
HDLBP-220ENST00000442730 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
HDLBP-220ENST00000442730 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.37■■■■■ 4.53
HDLBP-220ENST00000442730 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.13■■■■■ 4.49
HDLBP-220ENST00000442730 SMARCA4P51532 1647 aa42.44■■■■■ 4.38
HDLBP-220ENST00000442730 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
HDLBP-220ENST00000442730 NCAPD3P42695 1498 aa42.3■■■■■ 4.36
HDLBP-220ENST00000442730 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.28■■■■■ 4.36
HDLBP-220ENST00000442730 SMARCA2P51531 1590 aa42.21■■■■■ 4.35
HDLBP-220ENST00000442730 HMGXB3Q12766 1538 aa42.1■■■■■ 4.33
HDLBP-220ENST00000442730 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.05■■■■■ 4.32
HDLBP-220ENST00000442730 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.05■■■■■ 4.32
HDLBP-220ENST00000442730 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
HDLBP-220ENST00000442730 WIZO95785 1651 aa41.57■■■■■ 4.25
HDLBP-220ENST00000442730 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
HDLBP-220ENST00000442730 NESP48681 1621 aa41.4■■■■■ 4.22
HDLBP-220ENST00000442730 ERCC6Q03468 1493 aa41.34■■■■■ 4.21
HDLBP-220ENST00000442730 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.24■■■■■ 4.19
HDLBP-220ENST00000442730 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
HDLBP-220ENST00000442730 CUX2O14529 1486 aa41.06■■■■■ 4.16
HDLBP-220ENST00000442730 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.02■■■■■ 4.16
HDLBP-220ENST00000442730 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.94■■■■■ 4.14
HDLBP-220ENST00000442730 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.91■■■■■ 4.14
HDLBP-220ENST00000442730 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
HDLBP-220ENST00000442730 CFTRP13569 1480 aa40.74■■■■■ 4.11
HDLBP-220ENST00000442730 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.62■■■■■ 4.09
HDLBP-220ENST00000442730 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.59■■■■■ 4.09
HDLBP-220ENST00000442730 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.58■■■■■ 4.09
HDLBP-220ENST00000442730 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.57■■■■■ 4.08
HDLBP-220ENST00000442730 WDR62O43379 1518 aa40.5■■■■■ 4.07
HDLBP-220ENST00000442730 PRDM2Q13029 1718 aa40.4■■■■■ 4.06
HDLBP-220ENST00000442730 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
HDLBP-220ENST00000442730 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.14■■■■■ 4.02
HDLBP-220ENST00000442730 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
HDLBP-220ENST00000442730 TOPBP1Q92547 1522 aa39.9■■■■□ 3.98
HDLBP-220ENST00000442730 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.84■■■■□ 3.97
HDLBP-220ENST00000442730 ABCC8Q09428 1581 aa39.82■■■■□ 3.97
HDLBP-220ENST00000442730 IFT140Q96RY7 1462 aa39.73■■■■□ 3.95
HDLBP-220ENST00000442730 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
HDLBP-220ENST00000442730 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
HDLBP-220ENST00000442730 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
HDLBP-220ENST00000442730 CUX1P39880 1505 aa39.49■■■■□ 3.91
HDLBP-220ENST00000442730 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
HDLBP-220ENST00000442730 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.39■■■■□ 3.9
HDLBP-220ENST00000442730 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.36■■■■□ 3.89
HDLBP-220ENST00000442730 SOGA1O94964 1423 aa39.31■■■■□ 3.88
HDLBP-220ENST00000442730 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.882e-8■■■■■ 55.4
HDLBP-220ENST00000442730 OSCARQ8IYS5 282 aa39.2■■■■□ 3.87
HDLBP-220ENST00000442730 WDR97A6NE52 1622 aa39.17■■■■□ 3.86
HDLBP-220ENST00000442730 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
HDLBP-220ENST00000442730 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
HDLBP-220ENST00000442730 TOP2BQ02880 1626 aa39.05■■■■□ 3.84
HDLBP-220ENST00000442730 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.05■■■■□ 3.84
HDLBP-220ENST00000442730 SYNJ1O43426 1573 aa39.04■■■■□ 3.84
HDLBP-220ENST00000442730 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.99■■■■□ 3.83
HDLBP-220ENST00000442730 CHD1O14646 1710 aa38.98■■■■□ 3.83
HDLBP-220ENST00000442730 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.95■■■■□ 3.83
HDLBP-220ENST00000442730 GRIN2BQ13224 1484 aa38.93■■■■□ 3.82
HDLBP-220ENST00000442730 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.91■■■■□ 3.82
HDLBP-220ENST00000442730 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.88■■■■□ 3.81
HDLBP-220ENST00000442730 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
HDLBP-220ENST00000442730 PBRM1Q86U86 1689 aa38.85■■■■□ 3.81
HDLBP-220ENST00000442730 FBLN2P98095 1184 aa38.81■■■■□ 3.8
HDLBP-220ENST00000442730 SYNJ2O15056 1496 aa38.74■■■■□ 3.79
HDLBP-220ENST00000442730 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
HDLBP-220ENST00000442730 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
HDLBP-220ENST00000442730 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
HDLBP-220ENST00000442730 ARHGEF11O15085 1522 aa38.67■■■■□ 3.78
HDLBP-220ENST00000442730 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
HDLBP-220ENST00000442730 TRIM41Q8WV44 630 aa38.65■■■■□ 3.78
HDLBP-220ENST00000442730 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.6■■■■□ 3.77
HDLBP-220ENST00000442730 ADAMTS12P58397 1594 aa38.57■■■■□ 3.76
HDLBP-220ENST00000442730 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.52■■■■□ 3.76
HDLBP-220ENST00000442730 GRIN2AQ12879 1464 aa38.45■■■■□ 3.75
HDLBP-220ENST00000442730 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.43■■■■□ 3.74
HDLBP-220ENST00000442730 ARAP1Q96P48 1450 aa38.35■■■■□ 3.73
HDLBP-220ENST00000442730 NUP160Q12769 1436 aa38.31■■■■□ 3.72
HDLBP-220ENST00000442730 CEP170Q5SW79 1584 aa38.3■■■■□ 3.72
HDLBP-220ENST00000442730 KIF27Q86VH2 1401 aa38.26■■■■□ 3.72
HDLBP-220ENST00000442730 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.23■■■■□ 3.71
HDLBP-220ENST00000442730 IGF1RP08069 1367 aa38.15■■■■□ 3.7
HDLBP-220ENST00000442730 CUL7Q14999 1698 aa38.11■■■■□ 3.69
HDLBP-220ENST00000442730 SHROOM2Q13796 1616 aa38.08■■■■□ 3.69
HDLBP-220ENST00000442730 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.02■■■■□ 3.68
HDLBP-220ENST00000442730 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.02■■■■□ 3.68
HDLBP-220ENST00000442730 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.9■■■■□ 3.66
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