Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRP12Q9Y561 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRP12Q9Y561 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms