Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLF12Q9Y4X4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF12Q9Y4X4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms