Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms