Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SORCS3Q9UPU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS3Q9UPU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms