Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRPF3Q9ULD4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms