Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASS4Q9NQ75 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASS4Q9NQ75 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms