Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA1Q9NP55 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms