Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCIF1Q9H4Z3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCIF1Q9H4Z3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCIF1Q9H4Z3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms