Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms