Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHACTR1Q9C0D0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms