Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPCDR1Q9BY65 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPCDR1Q9BY65 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms