Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN1Q9BY11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN1Q9BY11 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms