Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms