Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM106CQ9BVX2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM106CQ9BVX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms