Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM42Q9BTD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM42Q9BTD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms