Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms