Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS25Q9BRG1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms