Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16BQ96JE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16BQ96JE7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.9 ms