Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3KBP1Q96B97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3KBP1Q96B97 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms