Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF428Q96B54 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF428Q96B54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF428Q96B54 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms