Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4orf3Q8WVX3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf3Q8WVX3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf3Q8WVX3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf3Q8WVX3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf3Q8WVX3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms