Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPAS3Q8IXF0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS3Q8IXF0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms