Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CASC2Q6XLA1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms