Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASCL4Q6XD76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms