Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LETMD1Q6P1Q0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LETMD1Q6P1Q0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms