Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms