Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBS0

TWF2, Twinfilin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF2Q6IBS0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF2Q6IBS0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF2Q6IBS0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF2Q6IBS0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF2Q6IBS0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF2Q6IBS0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF2Q6IBS0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF2Q6IBS0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF2Q6IBS0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF2Q6IBS0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms