Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC181Q5TID7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC181Q5TID7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC181Q5TID7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms