Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT12Q53H54 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMT12Q53H54 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms