Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROX2Q3B8N5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROX2Q3B8N5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms