Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RPEL1Q2QD12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPEL1Q2QD12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms